SynGene GeneGenius系统操作方法.docx

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1、SynGeneGeneGenius系统操作方法一、系统安装规程:一）系统硬件安装：1.打开计算机机箱盖，把系统图像捕捉卡插入计算机内部的pci插槽内.2 .盖上计算机盖后，把计算机与暗箱连线连好.3 .连接好计算机各处连线.4 .准备好两个多孔接线板，检查完墙上电源（220V）后，即可通电.二）系统软件安装：1.安装Windows95/98/2000系统平台软件.2 .安装GeneSnap软件,GeneTools软件（此时GeneTools软件为Demo版本），在安装GeneTools软件时，系统会要求输入SoftwareTitle（GeneTools）/UserName/Organizati

2、onName/MediaKey（此号位于GeneTools软件光盘盒内），依次输入后系统会产生RequestKey,并要求输入SecurityKey（如图1图3）图1（完成后点击NEXT“下一步”）图2（完成后点击NEXT “下一步”）获取密码前可先点击CANCEN“取消”，以完成别的任务）图3（在从厂家3 .安装打印机驱动软件.4 .重新启动计算机，进入BIOS/CMOS系统设置（对于DELL计算机应按F2进入）5 .把Periphalmode（外部插件模式）下的ParallelMode设置为ECP或Bi-direct方式;I/OAdress设置为378H;DMAMode设置为36 .如打印

3、机为三菱P91DW,则还应把后台打印方式改为EMF;及打印机面板上的Gamma值设为3以上7 .通过Email（内容为SoftwareTitle/UserName/OrganizationName/MediaKey等各项数据）向厂家（SynGene）申请SecurityCode,8 .获取SecurityCode后，打开计算机“开始/程序/SynGene/InstallWizard”并输入SecurityCode.此时GeneTools软件可正式使用，系统安装也正式（完成.如图4、图3DAKObaseJrKlz夹 6 任 双藏 档 置 我 助收 文 设 查 帮向色魏阂尊独a9防.注销Re ag

4、ent 1。）关闭系统也.eGeneGenius.MS-DOS方式MicrosoftAccessOutlook ExpressWindows资源管理器Adobe Acrobat 4.0WinZipUlead Photolmp&ct 4.0SiS Multimedia VI.28bDakoTapeSeymourNorton AntiVirusDAKObaseAdobe海淀园数字园区SraGeneCorelDRAW8瑞星杀毒*ag!-GeneGeniusPresentationGeneGeniusFeatures PresentationGeneTools HelpGeneTools Starte

5、rNotesGeneToolsinstallWizardUninstallGeneTools图4（点击打开 Install Wizard）9.（设置GeneSnap软件）打开GeneSnap软件进入菜单Extras/Initial后选择Dont open adocument on startup后点击OK然后退出GeneSnap软件并保存Configuration设置.10.再一次进入GeneSnap软件选择上一次保存的Configuration文件名后，退出二、系统开机及关机方法：一）开机方法：依次打开暗箱电源开关，打印机电源开关，显示器电源开关及计算机电源开关，数秒后即可二）关机方法：1.

6、选择Windows的“开始/关闭系统/选择关机后点击OK”即可关闭计算机2.依次关闭喑箱电源开关，打印机电源开关，显示器电源开关即可三、系统操作方法：一）图像捕获:1.开机进入Windows后，选择打开GeneSnap软件，软件界面如下图（图）GeneSnop- FdnQT.sgcFieWrdow E施as He画71 | kjU口口同|x|氢氢氢I IJJ JIq凶豫1里前jlrethickness 6lSdemogel_1FanUT.sgc百回三一CaptureImageImageCoplui)Raptureseries匿凶MANUAI/AUT0FREEZEkFXPOSFJ IIMAGE

7、IMAGELightingcontrolO UVCWMeC NoneSetsbnethckrmto6,团暮5）|j|GencSnap-FanQT.oc|%要4虢1213PM图5,GeneSnap软件界面（如软件安装中第9步未作设定，则图一中图像窗口将不可见。）2.图像的捕获（如图6）：a）自动捕获方式：（1）把所制胶板放入暗箱透照灯相应位置（DNA/RNA胶直接放置到紫外透照灯的黑玻璃上；蛋白胶实验则应先把白光转换板放置在紫外透照灯的黑玻璃上，再把蛋白胶放置到白光转换板上）（2）关上暗箱门（正确关闭后应有“咔嗒”声，同时“ImageCapture”窗口中的暗箱图标也将显示暗箱门关闭），在Ima

8、geCapture”窗口点击选择使用灯光类型（DNA/RNA/蛋白胶选用UV紫外灯，Colony/DotBlot选用White白光灯）后。（3）点击“ImageCapturen窗口的“AutoExpose”（自动图像捕获功能开关），暗箱会发出“嗒”的一声，同时所选灯光类型旁边“灯光是否打开显示”的指示将变红，数秒后计算机将自动选择并捕获一张计算机认为最佳的图像，并关闭暗箱灯光。b）序列捕获方式：（1）完成如a）方式中的第1步及第2步。（2）点击ImageCapturew窗口的ImageSeries（序列图像捕捉功能开关），在新出现的窗口中选择好所须照片数量（用按钮），相隔曝光时间（用按钮）后点

9、击“OK”，暗箱会发出“嗒”的一声，同时所选灯光类型旁边“灯光是否打开显示”的指示将变红，数秒后计算机将自动选择并捕获数张（用户所须数量）图像，并暗箱关闭灯光Setup：ure0.040sMANUAL自动图像捕捉功潴开关ZK象捕捉功能开关一暗箱门状态指示口暴光时间显示曝光时间调节按钮覆禁11葬臭火丁光是查疔开显示序列捕捉功熊开关选择打开紫夕卜火丁光LightingconUecrcrNon懿契普鹦开图6、图像捕获工具窗口（3）用户自行选择一幅最佳的图像后，把其它不需要的图像不保存关闭，即可。c）手动捕获方式：（1）完成如a）方式中的第1步及第2步（2）点击ImageCapture”窗口的“Liv

10、e/Focus”（手动实时捕获功能开关），暗箱会发出“嗒”的一声，同时所选灯光类型旁边“灯光是否打开显示”的指示将变红（3）（详见图6、图7（暂缺）调节ExposureTime”曝光时间（用曝光时间调节按钮调节）“ZoomIn”放大，“ZoomOut”缩小（点击红色的“ZoomIn”或“ZoomOut”图标调节）；“IrisOpen”扩大光圈，“IrisClose”缩小光圈（点击红色的“IrisOpen”或“IrisClose”图标调节）；“FocusNear”缩小焦距，“FocusFar”扩大胶距（点击红色的“FocusNear”或“FocusFar”图标调节）；以获取最佳图像质量（对于DN

11、A/RNA胶，当图像很弱时可调节积分按钮，如图9）（4）点击“ImageCapture”窗口的“ManualFreeze”（手动捕获图像冻结功能开关）后，计算机关闭暗箱灯光。3、图像说明（如图8）-Inlx|DNA胶扫描捕获图通信设置窗口demogel_1FanQT.sgcOEIB伪彩功能开关,哪光量、指示伽码值还原开关PHLdI2J亮度还原开关小调节开关图8,所获图像说明4、点击图9中文件保存按钮，在输入文件名，选择保存文件所在目录后；即可保存图像。二）图像处理：1、常规图像处理（参见图8、图9）当用户获取图像后，用户可选用伪彩（只能显示，不能打印）功能开关为图像选择伪彩；用亮度高低调节开关

12、，对比度大小调节开关优化图像质量；还可选用锐化功能按钮，平滑功能按钮，去处本底功能按钮等优化图像质量；用户也可选用图像左右旋转功能按钮，图像上下旋转功能按钮调节图像的位置。锐功按软件菜单缩钮去除本底阖节按钮覆GeneSnap FanUT.sgc择直选画线选画框择方择选画边选入选色图9,图像处理功能指示2、制作幻灯片用户可根据需要，选用黑白反转功能按钮制作科研报告所须幻灯片3、为图像添加标注用户可根据需要，选用画直线/画方框/画箭头/画多边形/输入字符等为图像添加标注4、特殊图像处理因SynGeneGeneGenius系统自动生成的文件为*.SGD格式的文件（安全格式文件）,故所获图像将保持最初

13、始的大小及形态，即使处理后也不能改变。如须改变必须依以下方式进行：a）选用图9中区域选择功能按钮，选择客户所须剪切的区域大小，如图10（暂缺）b）选用图9中图像剪切功能按钮，剪切并获得所须图像，如图11（暂缺）c）选用图9中软件菜单“File下“ExportImage”功能，如图12（暂缺）d）在新出现的窗口中，先选择保存文件所在的目录，输入文件名字，再选择文件转换后的类型（必须每次选择）后，点击“OK”按钮如图13（暂缺）三）凝胶（DNA/RNA/Protein）图像定量分析：1、常规图像（*.SGD文件图像）分析，方法如下（参见图9.图）：JSixa）在捕获胶图像并作图像处理后，直接点击图

14、9中图像分析按钮，即可进入分析软件，如图14GeneTools一IvLibrary.bvExtrasWindowHelp宣傣团IkHUNIUUa引卷干土IvLibrmlI助卜g|D|x|ForHelp,pressFl图14,图像分析软件界面b）在SampleProperties窗口中选择电泳的终点方向后即可点击“OK”按钮c）随后即将出现如图15的界面，在此界面中绿色区域为胶图像显示区域，粉色为峰值GeneTools- deaoeel_l. sgd!hFile Edit View Track Peak Extras Window Help |咨I|X|&aiii iia壬至运Rtzultzfor selected track |Rzultz for all tracks 11 Matchin comparisonsMWcal：v calibration | Ds 1111 1 11 CO4E6 71r V I I n r .26 5 6 36 6 3 4 64 4 8 4 19