材料计算｜｜MatCloud+自动高通量生成吸附模型.docx

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1、吸附建模的最大障碍是什么？ Matoud +帮您一键解决!上一篇文章，我们为大家介绍了自动化、高通量随机掺杂模型的搭建。除了取代掺杂这种方式以外，还可以通过搭建表面、界面结构来设计高性能新材料。构建表面后会导致表面原子的不饱和配位，通常通过吸附一些基团来饱和表面原子，也就是需要搭建相应的吸附模型；在催化、电池材料等领域，经常会设计各式各样的吸附剂，也会搭建各种吸附模型。今天给大家介绍高通量吸附建模神器一MatCloud+ ,帮你解决吸附建模的一切问题。图1吸附模型示意图吸附位点常见的有三种吸附位点:顶位、桥位和穴位。每一种吸附位点又可能包括多个不同的位:1）顶位（Ontop ）:表面原子正上方

2、的位置；2 ）桥位（Bridge ）:某一个表面原子与它第一近邻原子的中间位置;3）穴位（Hollow ）:三个、四个或者更多表面原子的中心位置。图2灰色的为表面原子；红色的为顶位位点；蓝色的为桥位位点；绿色的为穴位位点吸附模型如何搭建1、依据结构表面原子的周期性，存在着多个吸附位点，如何快速搭建包含所有吸附位点的模型？2、所有吸附模型中如何筛选并去除这些等价结构？3、如何在不等价的结构中筛选出最稳定或者是性能最优的结构？4、如何创建一定吸附浓度范围内的高通量吸附模型？吸附建模同取代建模一样让人无从下手MatCloud+ ,不需要下载及安装彳土可软件,通过云端操作，简单参数设置,即可完成高通量

3、吸附模型的构建。MatCloud+能够智能识别结构中的表面原子，依据表面原子的周期性自动寻找所有可能的吸附位点，高通量生成所有可能的吸附模型，且支持根据对称性去除等价结构。位点信息MoN(2)S名称关型坐标Q螟赖X：0(XXMY：1.7469Z：18.2273QX：1.4372Y：4.1923Z:18.0934O穴位X：2.8750Y：3.3772Z：18.1387Q位点4穴位X：1.4376Y：2.5621Z：18.1834a穴位X：4.3126Y：0.9022Z:18.1834O谈6穴位X：-2.8750Y：5.0370Z：18.1380琳肖图3 MatCloud+所有吸附位点的生成噎噎蹬

4、，接下来，我们以Mo2C吸附锂离子为例，说明MatCloud+平台如彳嗝通量得到吸附模型MatCloud +高通量吸附建模实例 原模型：Mo2C表面结构 吸附原子：Li 吸附个数：1 吸附表面：上表面 吸附高度：2 A(1)上传结构MatCloud+平台支持cif、POSCARx mok pdb等多种格式文件。故尧府 m有结构底机器学习数至客*snjgzhan0d*o., OSK 22结构名化学贰脍于皂质2WW创it时间搬作pipMie 仲ILU9LUC3233m2(12141944 UkMt；Sw女朝3iletpHI)4JhM卬3m2d21-W I4 l51(ijM 二 J.Di3he(Q0

5、1-U-MUBC32灯IP12021-OT44 1生】&44g地甘4世宵 lM9*lLkM1WgWM I546W嗜油区前龄7 MCIw2 m；Q5gahr (00 1)CM12IP1m2Ml944 ISU/lss隹蛔FS9 S5八OfCin2li2HI9XIS 16 7 46(也偏翼jAV.W 1c合Q7TO2IMO16Ti7MnlIP120JMI9mtWJ5212痣皿/K.WFSS1 r喧口gg中整M1Mh04*g转图4 MatCloud+上传结构(2)创建高通量吸附建模工作流MatCloud+的建模功能可以轻松的实现扩胞、切面、随机取代、建立吸附构型等操作。本例中，所需组件如下：点击输入控

6、制，将【通用导入组件】拖至右边的工作流设计页面，并导入表面结构；点击建模，将组件【吸附建模(原子)】拖至右边的工作流设计页面并连接成计算流程，如下图所示：图5 MatCloud+吸附建模工作流(3)设置高通量吸附建模参数并提交计算确定吸附原子类型：点选元素周期表中的原子类型； 点选确定吸附表面：上/下/双面; 手动设置基底到吸附物质的距离(吸附高度)；吸附浓度：通过指定吸附物质的个数控制吸附浓度。代色？” 士 KG高通量生成多个吸附位点位点信息Mo2C (2)图6 MatCloud+吸附原子参数设置全部添加位点名称类型坐标位点】顶位X：1.4985Y：0.8652Z：5.5453位点2穴位X：

7、2 9970Y：11303Z：5.5-153位点3穴位X：2 9970Y：00000Z：5.5453位点4桥位X：2 99-0Y：0.86Z：5.5453取消图7 MatCloud+高通量吸附位点的生成(4 )查看计算结果 展示所有吸附位点的吸附模型，并支持多行展示结构。8 4*UOTear”卡个收日9nMaX4Z9FU内 导出方式1 imn* I Mo：C39(3X7q、r1 M5t 1 11*asu购个IfMTQ9I0QJMa作ft* L付02六内” Q*l4M02C L I (3Lil 3 .U穴位A WBH图9 MatQoud+高通量吸附模型导出方式MatCloud +高通量吸附建模特点 云操作 建模功能组件化 拖拽式工作流 图形化高通量建模 自动筛选生成可能结构支持手动筛选输出结构及导出方式0 机时完成建模 注册即用便捷的自动化高通量吸附建模操作，你学会了吗？偷偷说一下，止助能组件目前可以免费使用，如此实用的功能，大家还不赶紧用起来！MatCloud+平台试用通道扫码申请试用