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1、耐多黏菌素肺炎克雷伯菌的诊治进展2023摘要近年来,多耐药及泛耐药的肺炎克雷伯菌检出率日益上升,因此,多黏菌素作为对大多数多耐药菌株依然敏感的抗生素,获得了越来越多的关注。然而,多黏菌素的广泛使用可能会对肺炎克雷伯菌产生诱导作用,使其产生耐药性。同时,异质性耐药现象的出现也增加了临床上对耐多黏菌素肺炎克雷伯菌的防治难度。目前临床上除了依赖多黏菌素联合其他抗生素来治疗耐多黏菌素肺炎克雷伯菌感染之外,新型抗菌药物的研发也成为研究的热点。同时探索对多黏菌素耐药性的早期检出方法有助于优化和完善耐多黏菌素肺炎克雷伯菌的诊疗策略。本文综述了近年来有关耐多黏菌素肺炎克雷伯菌的流行现状、产生机制、检出方法及其
2、防治措施。肺炎克雷伯菌是一种革兰阴性菌,属肠杆菌科(Enterobacteriaceaefami1y克雷伯菌属(KIebSie11aSPeCieS),主要存在于人类肠道、呼吸道及泌尿生殖道中,可与宿主共生,也可作为机会性病原体或病原体引发感染。根据中国疾控中心发布的20092023年间全国急性呼吸道感染患者的病原学检测结果,肺炎克雷伯菌是我国常见的呼吸道革兰阴性致病菌之一11肺炎克雷伯菌引发的感染多为机会性感染的医疗相关感染,死亡率较高,为临床诊治带来了较大困难,因此,对肺炎克雷伯菌防治措施的研究成为了临床上关注的重点。目前针对肺炎克雷伯菌的经验性治疗仍常用-内酰胺类、氨基糖苗类及唾诺酶类抗生
3、素,然而由于抗生素滥用带来的选择压力,近些年来肺炎克雷伯菌的耐药问题日益严重。根据中国细菌耐药监测网(CHINET)公布的20052023年的监测数据,肺炎克雷伯菌的耐药性逐年上升,耐药谱逐渐变广,这一现象大大限制了抗生素的使用。为了应对临床上愈发严重的耐药现象,多黏菌素作为一类对目前大多数多重耐药菌株敏感的抗生素,在临床上得到了广泛的应用。它是一种由多黏芽泡杆菌产生的环肽类阳离子抗生素,包括A、B、C、D、E五种类型,目前临床上仅使用多黏菌素B和多黏菌素E进行抗菌治疗20多黏菌素可与革兰阴性菌外膜脂多糖(1PS)中脂质A的磷酸基团结合,将自身疏水部分插入细胞膜,改变其通透性,随后通过自发摄取
4、机制透过外膜并将其破坏,导致细胞渗透失衡,达到杀菌目的。多黏菌素的杀菌机制还包括3:(1)使内外膜的磷脂小叶产生接触并发生磷脂交换,导致细胞渗透失衡;(2)诱导细菌产生羟基自由基,导致Fe3+流失和铁硫依赖蛋白失活;(3)抑制细菌内膜上的二型NADH脱氢酶(NDH2)活性,扰乱细菌新陈代谢;(4)以剂量依赖的方式与1PS分子结合,抑制脂质A的内毒素活性。然而,多黏菌素的使用可能会对肺炎克雷伯菌产生诱导作用,使其产生多黏菌素耐药性。多黏菌素类药物的耐药性最早主要由染色体介导进行垂直转移,而随着质粒介导多黏菌素耐药基因(mobi1eco1istinresistance,mcr)在多国被检出后,多黏
5、菌素耐药性的水平转移也成为关注的焦点,鉴于质粒介导耐药性水平转移的广泛性,加强对多黏菌素类药物耐药性的防范已刻不容缓。一、耐多黏菌素肺炎克雷伯菌流行情况过去十年间,全球碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的多黏菌素耐药率从不超过2%增至9%40美国、加拿大、南美和欧洲均报道了多次耐多黏菌素肺炎克雷伯菌的暴发流行。2013年来,欧洲的碳青霉烯类耐药菌株对多黏菌素的耐药率已上升至33%以上,意大利的CRKP多黏菌素耐药性高达43%,希腊为20.8%,西班牙为31%50根据2017年我国的一项多中心研究显示,我国临床分离到的耐多黏菌素肺炎克雷伯菌少而散发检出率约为0.7%。图1为CH1NET统计的
6、2017年至2023年全国1OOO余所医院中采集到的克雷伯菌属对多黏菌素的耐药情况。目前数据显示,我国的耐多黏菌素克雷伯菌检出数逐年增高,但总体的耐药率仍较低,多黏菌素依然是目前治疗多耐药肺炎克雷伯菌感染的强有力手段。二、肺炎克雷伯菌中常见的耐多黏菌素机制(-)作用靶点结构的改变多黏菌素作用靶点为细菌外膜1PS的脂质A,其耐药机制多与脂质A的结构改变有关,例如在脂质A中插入带正电荷的结构(如磷酸乙醇胺,pEtN和1-4-阿拉伯糖,1-Ara4N等)可减少与多黏菌素的静电相互作用,从而降低细菌对多黏菌素的敏感性6o介导这一过程的基因可位于染色体上,也可位于质粒等可移动遗传元件上。1. 双组分调控
7、系统(two-componentregu1ationsystem):双组分调控系统是细菌中一种重要的信号传递系统及基因表达调节系统,可介导细菌在阳离子抗菌肽环境中产生适应性。与多黏菌素耐药性相关的双组分调控系统包括pmrAB系统、phoPQ系统和ccrAB系统,它们之间还存在相互调控关系,共同介导耐药性的表达7o如图2所示,pmrAB系统和phoPQ系统被环境中的多黏菌素激活,具有组氨酸激酶活性的组分PmrB和PhoQ便催化效应调节蛋白PmrA和PhoP发生磷酸化,磷酸化的PhoP可上调pmrD基因的表达,进一步促进并使PmrA稳定于磷酸化状态,进而激活编码PEtN磷酸转移酶的pmrCAB操纵
8、子、参与脂多糖修饰过程的pmrE基因以及参与1-Ara4N合成的PmrHFIJK1M操纵子从而将pEtN或1-Ara4N插入脂质A2o同时,磷酸化的PhoP也可直接激活PmrHFIJK1MocrrAB系统主要通过调控下游的crrC基因(又名H239_3062基因)来影响细菌的多黏菌素耐药性。其组分CrrB基因发生突变时会上调crrC的转录进而导致PmrAB系统过表达7以及PmrHF11K1M操纵子、PmrC和pmrE基因的激活。此外,crrC还会与周围基因共转录,其中便包括编码RND型外排泵的H239_3064基因,该基因转录上调会导致菌株对多黏菌素、四环素及替加环素的耐药性增加。因而相比于其
9、他耐药机制,crrB的突变可导致肺炎克雷伯菌产生更强的耐药性7o2. mgrB基因:mgrB基因可通过抑制PhoQ的表达及抑制PhoP的磷酸化对phoPQ系统进行负反馈调节8,因此该基因的失活可导致PhoPQ系统表达上调,使菌株产生多黏菌素耐药性。mgrB常见的失活机制包括插入序列介导的基因重组以及基因突变导致的氨基酸序列改变或翻译过程提早终止,由于在临床上此类突变的检出率较高,因而一般认为mgrB基因突变是导致多黏菌素耐药性产生的重要机制。3. mcr基因:该基因编码的pEtN转移酶可介导pEtN结构插入脂质A,降低细胞膜与多黏菌素的结合亲和力90目前在自然界中已有多种重要的mcr等位基因检
10、出,肺炎克雷伯菌中常见亚型为mcr-1smcr-7和mcr-8o表1列出了较为重要的mcr-1至mcr-10等位基因最早被分离并报道的年份与地点10,11,12,13,14,15,16,17,18,19omcr-1的转移通常由插入序列ISApII介导,当基因两端存在该插入序列时,mcr-1会与之形成复合转座子,通过复制粘贴(copy-outzpaste-in)”机制进行转移,如转座子T633O(ISApII-mcr-1-OrfISApII)从质粒上被切下后形成的ISApII-mcr-1-orf中间产物可整合到其他携带ISApII的质粒中,造成耐药性的播散20o插入序列IS1也可出现在mcr-1
11、上游,协助其转座21相比mcr-1,mcr-7与mcr-8的检出率较低。研究发现,目前检出的此两种基因常与NaNDM等碳青霉烯酶基因共存于同一菌株中,如2023年中国报道了一株同时携带mcr-8sNaNDM及tmexCD1-toprJ1基因的肺炎克雷伯菌22,通常情况下这三种抗性基因均位于不同类型的质粒上,但在环境中多黏菌素的选择压力作用下,这三种抗性基因所在的质粒可在插入序列IS26和ItrA的介导下发生偶联,并且,多黏菌素的存在还提高了杂交质粒的稳定性。这一现象说明多黏菌素的使用可能会加速多耐药菌株的形成,为今后的临床诊治敲响了警钟。(二)屏障系统改变荚膜多糖(CPS)的生成增多研究表明,
12、CPS携带的负电荷可与多黏菌素携带的正电荷结合,从而阻止多黏菌素与脂多糖的结合,提高细菌的耐药性,这种保护作用与CPS的血清型或化学成分均无关,而是仅取决于菌株产生的CPS量。因而当CPS生成增多(如多黏菌素和乳铁蛋白可诱导CPS操纵子的表达上调)时,肺炎克雷伯菌对多黏菌素的耐药性便会增加23o(三)RamA基因与AcrABsOqxAB外排泵的活化RamA基因可在革兰阴性杆菌中调控多种药物耐药性的表达。该基因可与编码耗能型外排泵的acrAB基因和OqXAB基因的启动子结合,介导其表达上调,从而将多黏菌素从细胞质中排出,降低多黏菌素对细菌的杀伤作用240三、异质性耐药异质性耐药是指同一分离株的不
13、同亚群对抗菌药物表现出不同敏感性的现象,出现耐药性的亚群可逃逸抗菌药物的杀伤继续繁殖25,若异质性耐药株在抗菌药物压力下持续被选择,便会使该分离株对此类抗生素的抗性不断增加26o异质性耐药菌无法通过常规药敏试验发现,常被临床忽略,存在隐形危害。肺炎克雷伯菌多黏菌素异质性耐药的产生多与PhoPQ双组分系统的表达上调相关27,当PmrAB及PhoPQ系统组分发生突变或phoP、PhoQ、pmrD编码的mRNA显著过表达时,肺炎克雷伯菌亚群便会获得多黏菌素耐药性,出现异质性耐药。另外,日本学者于2023年报道了一株mutS基因突变介导产生多黏菌素异质耐药性的肺炎克雷伯菌SMKP03o该菌株上编码DN
14、A错配修复酶的mutS活性区域被无义突变截断,使菌株自发性产生多黏菌素耐药性的概率大大提高,从而更易产生多黏菌素异质耐药性280同时,介导1PS表达的IPXM基因与yciM基因缺失突变在表达异质性耐药的菌株中也有报道,说明1PS的表达上调也可导致多黏菌素异质性耐药现象的产生290四、耐多黏菌素肺炎克雷伯菌的快速检出目前多黏菌素的药敏检测方法和结果判定仍存在诸多争议。2016年欧洲抗菌药物敏感性试验委员会(EUCAST沐口美国临床实验室标准协会(C1SI)的多黏菌素折点联合工作小组共同推荐使用ISO-20776标准微量肉汤稀释法作为测定肠杆菌、铜绿假单胞菌和不动杆菌属对多黏菌素类药物体外敏感性的
15、参考方法,2023年针对肠杆菌和铜绿假单胞菌又新增了多黏菌素E肉汤纸片洗脱法和多黏菌素E琼脂实验25o但以上检测方法均用时较长、准确性低,难以广泛在常规医疗机构中开展,且目前临床上暂无统一的多黏菌素药物敏感性试验折点标准,为临床诊治带来了较大困难。为了快速评估细菌对多黏菌素的敏感性,国内外的学者在现有的检验技术上不断发展,探索出了一些更为高效的药敏早期评估方法。1快速多黏菌素NP试验30:该试验利用细菌生长时会进行糖酵解的特点,在已知浓度的多黏菌素中通过监测体系PH值的变化来测定葡萄糖发酵后产生的酸性代谢物浓度,反映细菌的生长状况,侧面评估细菌对多黏菌素的抗性。该试验方法简单,可在2h内得出结
16、果,其敏感度为99.3%,特异度为95.4%o2.环介导等温扩增技术(1AMP)31:该技术可用于对mcr-1基因的特异性检测。相比于常规聚合酶链式反应(PCR)技术,1AMP的成本更低、效率较高。该技术利用mcr-1基因的特异性引物与样本DNA混合进行扩增反应,检测限度0.2pg1,还可以用于检测粪便样本中的mcr-1基因。3.基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(Ma1di-TOF-MS)32:该技术目前已广泛应用于微生物的检测鉴定中,但对于微生物耐药性的检测仍具有一定的局限性。有学者提出可以利用革兰阴性菌的脂质A、革兰阳性菌的心磷脂和脂磷脂酸等微生物特异的脂质作为样本,不仅利于更高效地检测微生物的种类,且可用于多黏菌素抗性的检测。随后的学者对这一方法进行改进,优化了脂质提取的方法,改进后该试验操作简单,可在1h内完成对微生物种类及其对多黏