抗TACE抗体作用机制的研究.docx

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1、摘要：本文研究8糖甘酶的在消化系统中提高胃蛋白酶/胰蛋白酶抗性的研究。通过借助DS中的Modeller模块构建出绿色木霉中的3糖甘酶的三维结构，接着用ZDOCK将P糖甘酶分别与胃蛋白酶和胰蛋白酶进行对接，Rdock优化后找到最可能的结合构象。再次借助DS中的蛋白突变模块，对B糖甘酶进行突变设计，挑选出比较稳定的结果。最后通过实验的方法进行验证，得到的结果与计算结果一致，BGL1 Q627C和BGL1 Q627C/R543H/R646W这两个突变体对胃蛋白酶和胰蛋白酶的抗性都有所增加，同时酶活没有降低。本文的研究可以为其他饲料酶的改性提供参考。同源建模（Homology modeling）是利用

2、信息技术的手段，可以直接从蛋白的一级结构（氨基酸序列）预测蛋白质的高级结构（主要为三级结构）。人们可以通过使用一个或多个已知结构的蛋白（模板蛋白，template）来构建未知结构蛋白（目标蛋白，target）的空间结构。Discovery Studio为用户提供了一整套利用Homology Modeling方法自动预测蛋白质空间结构的工具。用户只需要提供蛋白质的氨基酸序列就可以轻松完成同源模型的构建及模型可信度评估的工作。蛋白对接（ZDOCK/RDOCK）是ZDOCK是一种基于快速傅里叶转化相关性技术的刚性蛋白对接算法。算法中快速傅里叶转化相关性技术被用于搜索蛋白蛋白系统的平动和转动空间。RD

3、OCK是一种基于CHARMm的能量优化过程，用于优化ZDOCK所寻找到的蛋白蛋白复合物的结合构型，并使用能量打分函数给这些结合构型打分。绿色木霉中8糖甘酶抗消化酶的理性设计ref： Enzyme and Microbial Technology ; IF=3.553链接：https:/doi.org/10.1016/j.enzmictec.2O19.109465绿色木霉中的B糖甘酶是糖甘水解酶家族的一员，8糖甘酶可以将纤维素和短链低聚糖水解为葡萄糖。B糖普酶提高了纤维素的利用率，在饲料工业中得到了广泛的应用。然而，饲料中添加的部分酶被动物的肠道消化酶破坏。提高B糖甘酶对消化酶（胃蛋白酶和胰蛋白

4、酶）的抗性，将使其在实践中更加经济有效。本文研究B糖苗酶的在消化系统中提高胃蛋白酶/胰蛋白酶抗性的研究。通过借助DS中的Modeller模块构建出绿色木霉中的8糖甘酶的三维结构,接着用ZDOCK将B糖甘酶分别与胃蛋白酶和胰蛋白酶进行对接，Rdock优化后找到最可能的结合构象。再次借助DS中的蛋白突变模块，对B糖苗酶进行突变设计，挑选出比较稳定的结果。最后通过实验的方法进行验证，得到的结果与计算结果一致，BGL1 Q627C和BGL1Q627C/R543H/R646W这两个突变体对胃蛋白酶和胰蛋白酶的抗性都有所增加，同时酶活没有降低。本文的研究可以为其他饲料酶的改性提供参考。20QSB125250375SOO62SRow Index图一构建绿色木霉中3糖甘酶的三维结构。pose 11posc288pose 126pose 176posc70i图二B糖甘酶与胃蛋白酶，BGL1Q627c与胰蛋白酶对接打分最高的5个结果MaXFlow生物医药智能创新平台，由创腾科技自主研发，旨为不同领域的一线创新科技工作者提供一个合作共享的B-S架构平台。以“数据自由，模型自由”为理念,在结构模型与预测模型进行融合的基砒匕实现模拟与AI需求的合并，为研发赋能。